Гаплогруппа D (Y-ДНК)

Гаплогруппа D (M174) — гаплогруппа ДНК Y-хромосомы. Как гаплогруппа D, так и E содержат однонуклеотидный полиморфизм M168, который имеется во всех гаплогруппах, кроме A и B (см. группа CT), а также полиморфизм уникального события YAP, уникальный для гаплогруппы DE — общего предка D и Е.

Гаплогруппа D
Haplogrupo_D_(ADN-Y).png
Тип Y-ДНК
Время появления 60 тыс. лет назад[1]
Место появления Центральная Азия[2]
Предковая группа DE
Сестринские группы E
Субклады D1a, D1b, D2
Мутации-маркеры M174, 021355
Гипотетический северный маршрут миграции носителей гаплогруппы D

Содержание

Происхождение

По мнению Т. Карафет, гаплогруппа D возникла в Азии около 60 тыс. лет назад.[1][3] Хотя как D, так и E содержит характерный полиморфизм уникального события YAP (YAP), указывающий на их общее происхождение, гаплогруппа D не была обнаружена за пределами Азии.[3]

Палеогенетика

  • Гаплогруппа D обнаружена у образца Ma91 (ок. 4319 л. н.) из Малайзии[4].
  • Субклад D1b2b выявлен у представителя культуры Дзёмон, жившего примерно 3500—3800 лет назад[5].

Обзор

В настоящее время встречается с высокой частотой среди населения Тибета, Японского архипелага[6] и Андаманских островов, однако, в силу неизвестных обстоятельств, пока не обнаружена на полуострове Индостан. Айны в Японии, а также народы джарава и онге на Андаманских островах имеют почти исключительно данную гаплогруппу, хотя у айнов кроме гаплогруппы D1b (81,3%[7]) с частотой около 15 % также встречается Y-хромосомная гаплогруппа C3.

Также хромосомы с гаплогруппой D обнаружены с низкой или умеренной частотой у народов Центральной Азии и севера Восточной Азии, а также у китайцев-хань и народов мяо-яо в Китае и некоторых национальных меньшинств китайских провинций Сычуань и Юньнань, говорящих на тибето-бирманских языках и проживающих в непосредственной близости от тибетцев.

В отличие от гаплогруппы C, гаплогруппа D не мигрировала из Азии через Берингию в Новый Свет.

Гаплогруппа D также примечательна своей исключительной географической дифференциацией, когда определённый подкласс гаплогруппы чётко локализуется в какой-либо популяции, где большой процент лиц имеют гаплогруппу D:

Такая, по-видимому, древняя диверсификация гаплогруппы D заставляет предположить, что её скорее следует охарактеризовать как «супергаплогруппу», «макрогаплогруппу». Частота встречаемости D1a в Корее составляет 8 %; кроме того, этот подкласс часто встречается в Тибете и у сино-тибетских народов в Китае.

Особо характерными являются примеры гаплогруппы D у населения Японских островов, поскольку они содержат комплекс из как минимум пяти отдельных мутаций, свойственных гаплогруппе D, что ясно отличает их от гаплогруппы D, обнаруженной у жителей Тибета и Андаманских островов. Этот факт является свидетельством того, что гаплогруппа D1b была модальной гаплогруппой доисторической культуры Дзёмон на Японских островах.

Подклассы

Филогенетическое дерево

Приведенное ниже филогенетическое дерево гаплогруппы D основано на публикации YCC 2015 Т. М. Карафет[8] и последующих публикациях. ISOGG 2017(ver.12.241)[9]

  • DE
    • D (M174/Page30, IMS-JST021355)
      • D* - Андаманские острова (Джарава)[10]
      • D1 (CTS11577) - Гуам
        • D1a (Z27276)
        • D1b (M55, M57, M64.1/Page44.1, M179/Page31, M359.1/P41.1, P37.1, P190, 12f2.2) - Япония
          • D1b1 (M116.1)
            • D1b1a (M125)
              • D1b1a1 (P42)
                • D1b1a1a (P12_1, P12_2, P12_3)
              • D1b1a2 (IMS-JST022457) - Император Японии[11][12]
                • D1b1a2a (P53.2)
                • D1b1a2b (IMS-JST006841/Page3)
                  • D1b1a2b1 (CTS3397)
                    • D1b1a2b1a (Z1500)
                      • D1b1a2b1a1 (Z1504, CTS8093) - Минамото[11][12]
                        • D1b1a2b1a1a (FGC6373) - Японцы(Хиросима)
                          • D1b1a2b1a1a1 (L137.3) - Японцы(Сидзуока)
                            • D1b1a2b1a1a1a (Z40625)
                            • D1b1a2b1a1a1b (CTS217)
                            • D1b1a2b1a1a1c (Z38475)
                          • D1b1a2b1a1a2 (FGC6372)
                          • D1b1a2b1a1a3 (CTS10649)
                          • D1b1a2b1a1a4 (Z40609)
                        • D1b1a2b1a1b (Z40614)
                        • D1b1a2b1a1c (Z31543)
                        • D1b1a2b1a1d (FGC30021)
                        • D1b1a2b1a1e (Z31548)
                        • D1b1a2b1a1f (Z31553)
                        • D1b1a2b1a1g (CTS6223)
                        • D1b1a2b1a1h (CTS4093)
                        • D1b1a2b1a1i (Z40687)
                          • D1b1a2b1a1i1 (Z35641)
                          • D1b1a2b1a1i2 (Z40688)
                        • D1b1a2b1a1j (CTS5058)
                        • D1b1a2b1a1k (FGC34008)
                      • D1b1a2b1a2 (CTS266)
                      • D1b1a2b1a3 (Z40672)
                    • D1b1a2b1b (CTS1372)
                  • D1b1a2b2 (CTS5581)
              • D1b1a3 (CTS10972)
                • D1b1a3a (Z31538)
                • D1b1a3b (CTS232)
            • D1b1b (P120)
            • D1b1c (CTS6609)
              • D1b1c1 (CTS1897/Z1574)
                • D1b1c1a (CTS11032) - Японцы(Айти)
                  • D1b1c1a1 (CTS218/V1105/Z1527)
                    • D1b1c1a1a (CTS6909)
                      • D1b1c1a1a1 (CTS6969)
                      • D1b1c1a1a2 (CTS9770)
                    • D1b1c1a1b (CTS3033)
                      • D1b1c1a1b1 (M2176)
                      • D1b1c1a1b2 (CTS2472)
                    • D1b1c1a1c (M151)
                  • D1b1c1a2 (F8521.3)
                • D1b1c1b (CTS1964)
                  • D1b1c1b1 (CTS974)
                  • D1b1c1b2 (CTS722)
                • D1b1c1c (Z30644) - Японцы(Фукусима)
                  • D1b1c1c1 (CTS4292)
                    • D1b1c1c1a (Z31517)
                    • D1b1c1c1b (CTS1798)
                  • D1b1c1c2 (Z31512)
                • D1b1c1d (CTS5641) - Японцы(Киото)
                • D1b1c1e (CTS429)
              • D1b1c2 (CTS103)
                • D1b1c2a (Z42462)
          • D1b2 (CTS131)
      • D2 (L1366, L1378, M226.2) - Филиппины (Мактан)[9]
        • D2a (FGC8848)
        • D2b (FGC8940)

Распространение

D1a2a (P47)

D1a2a (ранее D3a) встречается с высокой частотой среди тибетцев[15], со средней частотой среди ряда других народов юга Центральной Азии. Наиболее высокая частота — среди народа пуми — составляет 70 %.


Примечания

  1. 1 2 Shi et al. (2008) Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations, BMC Biology
  2. Matsumoto H (February 2009). "The origin of the Japanese race based on genetic markers of immunoglobulin G". Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and Biological Sciences. 85 (2): 69–82. Bibcode:2009PJAB...85...69M. doi:10.2183/pjab.85.69. PMC 3524296. PMID 19212099.
  3. 1 2 Ошибка в сносках?: Неверный тег <ref>; для сносок Karafet не указан текст
  4. Hugh McColl et al. Ancient Genomics Reveals Four Prehistoric Migration Waves into Southeast Asia, 2018
  5. POB-162 Phenotype and phylogeny of Neolithic Japanese hunter-gatherers, Jomon people, based on whole nuclear genome sequences // SMBE 2018 Архивная копия от 7 июля 2018 на Wayback Machine
  6. Michael F. Hammer, Tatiana M. Karafet, Hwayong Park, Keiichi Omoto, Shinji Harihara, Mark Stoneking and Satoshi Horai, «Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes», Journal of Human Genetics Volume 51, Number 1 / January, 2006.
  7. Yusuke Watanabe, Izumi Naka, Seik-Soon Khor, Hiromi Sawai, Yuki Hitomi, Katsushi Tokunaga, Jun Ohashi Analysis of whole Y-chromosome sequences reveals the Japanese population history in the Jomon period, 2019
  8. Karafet et al. (2015), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  9. 1 2 Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2017
  10. YFull
  11. 1 2 famous Y dna by haplogroup
  12. 1 2 List of haplogroups of famous/notable people
  13. 神澤ほか(2016)「礼文島船泊縄文人の核ゲノム解析」第70回日本人類学大会[1]
  14. ysearch DNA of Kimura (D-CTS11285) (недоступная ссылка)
  15. Dongsheng Lu et al. Ancestral Origins and Genetic History of Tibetan Highlanders, August 25, 2016

Литература

См. также

Y-хромосомный Адам
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1  F2  F3    GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
I J LT (K1) K2
L (K1a)   T (K1b)       K2a/K2a1/NO/NO1 K2b
N O   K2b1     P (K2b2)/P1  
  S (K2b1a) M (K2b1b) Q R  

Ссылки