Сайт-специфическая рекомбинация

Сайт-специфическая рекомбинация — тип генетической рекомбинации в которой при обмене цепей ДНК происходит реакция между специфическими cайтами[1][2][3] Перестановка сегментов ДНК происходит путем распознавания и связывания коротких последовательностей ДНК (сайтов), в которых специальные ферменты расщепляют, переставляют и снова соединяют цепи ДНК. Для одних систем рекомбинации достаточно только фермента рекомбиназы, другие же требуют наличия дополнительных факторов. В природе сайт-специфическая рекомбинация случается при интеграции вируса в геном (образование провируса).

Системы сайтспецифической рекомбинации высокоспецифичны, быстры и эффективны даже при работе со сложными эукариотическими геномами[4] и по этой причине широко используются в генетической инженерии[5] Они участвуют во множестве клеточных процессов, включая репликацию бактериального генома, патогенез, передвижение мобильных генетических элементов и образовании антител в лимфоидных клетках млекопитающих.

Сайты рекомбинации обычно имеют длину от 30 до 200 нуклеотидов и состоят из двух инвертированных повторов, с которыми связывается рекомбиназа, между которыми располагается последовательность по которой и происходит рекомбинация. Оба сайта по которым происходит рекомбинация как правило идентичны, но бывают и исключения (например сайты интеграции фага λ attP и attB, см. фаг лямбда)[6].

См. также

  • Cre-Lox рекомбинация[en]
  • FLP-FRT рекомбинация[en]

Примечания

  1. Bode, J; Schlake, T; asadasasada Iber, M; Schuebeler, D; Seibler, J; Snezhkov, E; Nikolaev, L. The transgeneticist's toolbox: novel methods for the targeted modification of eukaryotic genomes (англ.) // Biol. Chem. (англ.) : journal. — 2000. — Vol. 381, no. 9—10. — P. 801—813. — DOI:10.1515/BC.2000.103. — PMID 11076013.
  2. Kolb, A.F. Genome Engineering Using Site-Specific Recombinases (англ.) // Cloning & Stem Cells : journal. — 2002. — Vol. 4, no. 1. — P. 65—80. — DOI:10.1089/153623002753632066. — PMID 12006158.
  3. Coates, C.J.; Kaminski, JM; Summers, JB; Segal, DJ; Miller, AD; Kolb, A. F. Site-directed genome modification: derivatives of DNA-modifying enzymes as targeting tools (англ.) // Trends in Biotechnology (англ.) : journal. — Cell Press (англ.), 2005. — Vol. 23, no. 8. — P. 407—419. — DOI:10.1016/j.tibtech.2005.06.009. — PMID 15993503. Архивировано 29 августа 2006 года.
  4. Sauer, B. Inducible Gene Targeting in Mice Using the Cre/loxSystem (англ.) // Methods : journal. — 1998. — Vol. 14, no. 4. — P. 381—392. — DOI:10.1006/meth.1998.0593. — PMID 9608509. Архивировано 11 июня 2011 года.
  5. Akopian, A.; Stark, W.M. Site-Specific DNA Recombinases as Instruments for Genomic Surgery (англ.) // Advances in Genetics : journal. — 2005. — Vol. Advances in Genetics. — P. 1—23. — ISBN 978-0-12-017655-7. — DOI:10.1016/S0065-2660(05)55001-6.
  6. Landy A. Dynamic, Structural, and Regulatory Aspects of lambda Site-Specific Recombination (англ.) // Annual Review of Biochemistry (англ.) : journal. — 1989. — Vol. 58, no. 1. — P. 913—941. — DOI:10.1146/annurev.bi.58.070189.004405. — PMID 2528323.