Транслоказы

Транслоказы - отдельный класс ферментов, катализирующих перенос ионов или молекул через мембраны или их разделение в мембранах. Этот класс ферментов сформировался из ранее принадлежащих другим классам ферментов.[1]

АТФ-синтаза - ранее фермент относился к третьему классу и был назван по номенклатуре - АТФ-фосфогидролаза, но название не соответствует характеру работы фермента, т.к. гидролиз АТФ практически не происходит.

За ферментами, перемещёнными в класс транслоказ, сохранились прежние систематические названия.

Катализируемые реакции

Ферменты седьмого класса катализируют реакции переноса молекул или ионов через мембраны, сопряженный с другими реакциями.

Например, при переносе протонов из матрикса в межмембранное пространство через комплекс I[2] электронно транспортной цепи происходит восстановление убихинона до убихинола и реакция описывается следующей схемой:

NADH + Сo Q + 6 H+[side 1] = NAD+ + Сo QH2 + 7 H+[side 2]

Второй пример АТФ-синтаза, катализирующая реакцию переноса ионов водорода из межмембранного пространства в матрикс с образованием при этом молекулы АТФ из АДФ и неорганического фосфата, реакция описывается схемой[3]:

АДФ + Фн → АТФ + H2O

Номенклатура

За ферментами сохранились систематические названия, указывающие на их прежний класс.

В зависимости от переносимых ионов или молекул в седьмом классе выделяют шесть подклассов.

EC 7.1 - ферменты, катализирующие транслокацию протонов водорода H+;

EC 7.2 - ферменты, катализирующие транслокацию неорганических катионов и их хелатов;

ЕС 7.3 - ферменты, катализирующие транслокацию неорганических анионов;

EC 7.4 - ферменты, катализирующие транслокацию аминокислот и пептидов;

EC 7.5 - ферменты, катализирующие транслокацию углеводов и их производных;

EC 7.6 - ферменты, катализирующие транслокацию иных соединений.

Деление на под-подклассы основано на реакциях, которые обеспечивают движущую силу для транслокации:

EC 7._.1 - ферменты, катализирующие реакции транслокации, связанные с реакциями окисления-восстановления;

EC 7._.2 - ферменты, катализирующие реакции транслокации, связанные с гидролизом нуклеозидтрифосфата;

EC 7._.3 - ферменты, катализирующие реакции транслокации, связанные с гидролизом дифосфата;

EC 7._.4 - ферменты, катализирующие реакции транслокации, связанные с реакцией декарбоксилирования.

К ферментам этого класса не относятся каналы (поры), изменяющие конформацию между открытым и закрытым состоянием в ответ на какое либо воздействие, а так же транспортеры, которые не зависят от фермент-катализируемых реакций.

Примечания

  1. Международный союз биохимии и молекулярной биологии. Новый класс ферментов: транслоказы.. IUBMB NEWS (Август 2018).
  2. НАДН:убихинон редуктаза. IUBMB Enzyme Nomenclature.
  3. АТФ-синтаза. IUBMB Enzyme Nomenclature.